集团始创之初,即推行现代企业管理制度,完善集团的公司最高权力机构——股东大会,健全董事会、监事会。在董事会内,设置战略决策中心、工程建设运营管理中心、党政办公室、财务管理中心、远程管理中心、审计监察中心,实现决策、执行和监督等各项职能清晰分工,既相互制约又协调统一。


集团北京总部设置医院管理中心(下设医院运营管理部、医生集团建设管理部)、康复管理中心、月子管理中心、投融资中心、酒店管理事业中心、资产与物业运营管理中心、企划宣传中心、行政管理中心(下设人力资源管理与开发部、综合部)。


集团总部对各省会和省辖项目公司实施统一管控和资源综合调度。集团以甘肃地区作为全国项目运作的示范基地,在兰州设立了全资子公司,即甘肃省公司,负责在甘肃地区落地总部各项职能。省公司设置成本管控中心(下设合约部、物资部、预算部)、工程建设管控中心(下设工程建设部)、工程技术管控中心(规划设计部)、市场运营管理中心(下设营销策划部、招商部、企划宣传部)、行政管理中心(下设医生集团建设管理部、综合办公室、人力资源管理与开发部)、投融资事业中心(下设银行业务部、基金业务部、财务部)。


已实施的靖远和庆城项目分别设立省辖项目开发公司、项目医管公司、项目经营公司和项目物业管理公司,并已于2015年全面启动建设。